Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pnma8aQ80VM8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pnma8aQ80VM8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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