Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsf18Q7TS55 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms