Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms