Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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