Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smim12Q78RX3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smim12Q78RX3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms