Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nme8Q715T0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nme8Q715T0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Nme8Q715T0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Nme8Q715T0 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Nme8Q715T0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Nme8Q715T0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Nme8Q715T0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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