Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Syne1Q6ZWR6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Syne1Q6ZWR6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Syne1Q6ZWR6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Syne1Q6ZWR6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Syne1Q6ZWR6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Syne1Q6ZWR6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Syne1Q6ZWR6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Syne1Q6ZWR6 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Syne1Q6ZWR6 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Syne1Q6ZWR6 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Syne1Q6ZWR6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms