Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Topbp1Q6ZQF0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms