Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccdc88cQ6VGS5 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccdc88cQ6VGS5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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