Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

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Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx13Q6PHS6 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx13Q6PHS6 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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