Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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