Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm4Q6IRU2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Tpm4Q6IRU2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms