Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt40Q6IFX3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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