Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Arhgap20Q6IFT4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Arhgap20Q6IFT4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgap20Q6IFT4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgap20Q6IFT4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgap20Q6IFT4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgap20Q6IFT4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgap20Q6IFT4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgap20Q6IFT4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgap20Q6IFT4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgap20Q6IFT4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgap20Q6IFT4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Arhgap20Q6IFT4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Arhgap20Q6IFT4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Arhgap20Q6IFT4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgap20Q6IFT4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Arhgap20Q6IFT4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgap20Q6IFT4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgap20Q6IFT4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgap20Q6IFT4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgap20Q6IFT4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgap20Q6IFT4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgap20Q6IFT4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgap20Q6IFT4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Arhgap20Q6IFT4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Arhgap20Q6IFT4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Arhgap20Q6IFT4 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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Arhgap20Q6IFT4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Arhgap20Q6IFT4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Arhgap20Q6IFT4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Arhgap20Q6IFT4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Arhgap20Q6IFT4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Arhgap20Q6IFT4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Arhgap20Q6IFT4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Arhgap20Q6IFT4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Arhgap20Q6IFT4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Arhgap20Q6IFT4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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