Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scaf8Q6DID3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms