Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms