Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

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Length 675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms