Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rftn1Q6A0D4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms