Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
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