Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sptbn2Q68FG2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms