Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms