Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kdm5dQ62240 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm5dQ62240 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms