Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Rbm38Q62176 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Rbm38Q62176 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Rbm38Q62176 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Rbm38Q62176 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Rbm38Q62176 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Rbm38Q62176 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Rbm38Q62176 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Rbm38Q62176 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Rbm38Q62176 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Rbm38Q62176 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Rbm38Q62176 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Rbm38Q62176 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbm38Q62176 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms