Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ctr9Q62018 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ctr9Q62018 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ctr9Q62018 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ctr9Q62018 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ctr9Q62018 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ctr9Q62018 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ctr9Q62018 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ctr9Q62018 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctr9Q62018 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms