Protein–RNA interactions for Protein: Q61501

E2f1, Transcription factor E2F1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f1Q61501 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2f1Q61501 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2f1Q61501 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2f1Q61501 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2f1Q61501 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2f1Q61501 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2f1Q61501 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2f1Q61501 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2f1Q61501 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
E2f1Q61501 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2f1Q61501 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2f1Q61501 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2f1Q61501 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
E2f1Q61501 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f1Q61501 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f1Q61501 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f1Q61501 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f1Q61501 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f1Q61501 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f1Q61501 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f1Q61501 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f1Q61501 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f1Q61501 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f1Q61501 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f1Q61501 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
E2f1Q61501 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms