Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms