Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Foxd1Q61345 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Foxd1Q61345 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Foxd1Q61345 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Foxd1Q61345 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Foxd1Q61345 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Foxd1Q61345 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Foxd1Q61345 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms