Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

Predictions only

Length 3,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RelnQ60841 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RelnQ60841 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RelnQ60841 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RelnQ60841 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RelnQ60841 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RelnQ60841 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RelnQ60841 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RelnQ60841 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RelnQ60841 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RelnQ60841 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RelnQ60841 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RelnQ60841 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RelnQ60841 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RelnQ60841 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RelnQ60841 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RelnQ60841 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RelnQ60841 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RelnQ60841 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RelnQ60841 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RelnQ60841 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RelnQ60841 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RelnQ60841 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RelnQ60841 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RelnQ60841 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RelnQ60841 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RelnQ60841 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RelnQ60841 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RelnQ60841 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RelnQ60841 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RelnQ60841 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms