Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms