Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn3Q60764 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms