Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms