Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam71bQ5STT6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms