Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms