Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms