Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bhlha9Q5RJB0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms