Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT8

Pnma5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma5Q5DTT8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnma5Q5DTT8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnma5Q5DTT8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnma5Q5DTT8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnma5Q5DTT8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnma5Q5DTT8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnma5Q5DTT8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnma5Q5DTT8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnma5Q5DTT8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnma5Q5DTT8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnma5Q5DTT8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnma5Q5DTT8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnma5Q5DTT8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnma5Q5DTT8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnma5Q5DTT8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnma5Q5DTT8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms