Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms