Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Eme2Q56A04 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Eme2Q56A04 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Eme2Q56A04 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Eme2Q56A04 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Eme2Q56A04 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Eme2Q56A04 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Eme2Q56A04 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms