Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
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CenpjQ569L8 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenpjQ569L8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenpjQ569L8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenpjQ569L8 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenpjQ569L8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
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CenpjQ569L8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenpjQ569L8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenpjQ569L8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenpjQ569L8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenpjQ569L8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenpjQ569L8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenpjQ569L8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenpjQ569L8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenpjQ569L8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenpjQ569L8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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CenpjQ569L8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenpjQ569L8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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CenpjQ569L8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenpjQ569L8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenpjQ569L8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CenpjQ569L8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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CenpjQ569L8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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CenpjQ569L8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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CenpjQ569L8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CenpjQ569L8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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CenpjQ569L8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CenpjQ569L8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CenpjQ569L8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CenpjQ569L8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CenpjQ569L8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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CenpjQ569L8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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CenpjQ569L8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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CenpjQ569L8 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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CenpjQ569L8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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CenpjQ569L8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CenpjQ569L8 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CenpjQ569L8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CenpjQ569L8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CenpjQ569L8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CenpjQ569L8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CenpjQ569L8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CenpjQ569L8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CenpjQ569L8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CenpjQ569L8 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CenpjQ569L8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CenpjQ569L8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CenpjQ569L8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CenpjQ569L8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CenpjQ569L8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CenpjQ569L8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CenpjQ569L8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CenpjQ569L8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CenpjQ569L8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CenpjQ569L8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CenpjQ569L8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CenpjQ569L8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CenpjQ569L8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CenpjQ569L8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms