Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Spire1Q52KF3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Spire1Q52KF3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Spire1Q52KF3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Spire1Q52KF3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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