Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms