Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms