Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Ccdc185Q3V118 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Ccdc185Q3V118 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ccdc185Q3V118 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ccdc185Q3V118 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc185Q3V118 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ccdc185Q3V118 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ccdc185Q3V118 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ccdc185Q3V118 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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