Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms