Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Rnpc3Q3UZ01 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Rnpc3Q3UZ01 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnpc3Q3UZ01 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms