Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Kdm5aQ3UXZ9 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
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Kdm5aQ3UXZ9 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Kdm5aQ3UXZ9 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Kdm5aQ3UXZ9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Kdm5aQ3UXZ9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm5aQ3UXZ9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Kdm5aQ3UXZ9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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