Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms