Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Skap2Q3UND0 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms