Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms