Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttll12Q3UDE2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll12Q3UDE2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms